Algoritmusok a bioinformatikában: Elmélet és megvalósítás

Olvasói vélemények

A könyv a bioinformatika innovatív és átfogó feltárását nyújtja, a terület egyik szaktekintélyének szerzőjeként. Hatékonyan egyszerűsíti az összetett fogalmakat, és világosan megmutatja a témák közötti kapcsolatokat, így jól alkalmazható a felsőfokú tanulmányokat folytató egyetemisták és doktoranduszok számára.

A szerző világosan elmagyarázza a bonyolult fogalmakat, az összetett anyagot könnyen érthető módon mutatja be, átfogó ismeretekről tesz tanúbizonyságot a filogenetika és a genomika területén, számos kódpéldát tartalmaz, és világosan elkülöníti a véleményt a tényektől.

A könyv inkább azoknak az olvasóknak lehet hasznos, akik már legalább haladó kezdő informatikusok.

(1 olvasói vélemény alapján)

Eredeti címe:

Algorithms in Bioinformatics: Theory and Implementation

Könyv tartalma:

Algoritmusok a bioinformatikában: A bioinformatika tömör, mégis átfogó tankönyve, amely ismerteti a biológiai funkciók és összefüggések feltárására használt legfontosabb algoritmusokat. Az Algoritmusok a bioinformatikában című egyedülálló útmutató a matematika, a megvalósítás, a szimuláció és a kísérletezés négy konvergens vonala mentén közelíti meg a témát, és ideális lehet felsőfokú bioinformatikai kurzusok, kutatók, doktoranduszok, valamint adatelemzéssel megbízott szociológusok vagy mérnökök számára.

A mű először egy általános bevezetéssel kezdődik a biológiába, amely a bioinformatika területét érintő molekuláris folyamatok konkrétabb megértését hivatott szolgálni. Ezt a bevezetést követően olyan témaköröket tekintünk át részletesen, mint a szekvenciaillesztés, a kényszerített illesztés, a motívumok felismerése, a szekvencia-logok, a markov-láncok vagy az információs entrópia. Más újszerű megközelítések is ismertetésre kerülnek, mint például az önszekvencia-illesztés, az objektív digitális foltok (ODS) vagy a spektrális előrejelzés és a diszkrét valószínűségi detektor (DPD) algoritmus.

A munka alapos, lépésről lépésre történő magyarázatot is tartalmaz a háttérmodellek bioinformatikai jelentőségére vonatkozóan, több szempontból is. Ennél is fontosabb, hogy bevezeti az olvasót az algoritmusok művészetébe; bemutatja, hogyan kell számítógépes implementációkat tervezni, és részletes esettanulmányokkal ellátott, kiterjedt munkapéldákkal szolgál.

Az itt bemutatott megvalósítások rámutatnak arra, hogy a javascriptben történő natív programozás hogyan szélesítheti a bioinformatikai lehetőségek horizontját, figyelembe véve a modern internetböngészők erejét. A számítási algoritmusok technikai részleteihez grafikus illusztrációkat használunk, hogy segítsük a belső működésük mélyebb megértését.

A mű emellett több mint 100 nyílt forráskódú implementációt és 33 powerpoint prezentációt tár az olvasó elé.