A Saphy és a Cachimayu folyók környezeti problémát jelentenek Cusco városában, mivel a háztartási szennyvíz, a szemét és a szilárd hulladék, a foszfátos mosószerek használata stb.
miatt. Vizeik szerves és szervetlen szennyezőanyagokat tartalmaznak, amelyek veszélyt jelentenek a közegészségügyre.
Fontos meghatározni a két folyó minőségi veszteségét, hogy politikákat és programokat lehessen javasolni a minimalizálásra, ellenőrzésre és helyreállításra; a kutatás célja a két folyó vízminőségi indexének (WQI) kiszámítása volt, amely egységes módszer a hasonló jellemzőkkel rendelkező folyók vízminőségének mérésére szolgál. A WQI meghatározását az NSF módszertanát követve végezték; e módszertan alkalmazásával a két folyóban minőségromlást azonosítottak, amelyet meg kell őrizni: a Saphy folyó WQI-je 72-ről 45-re csökken, a BOD5 pedig 32-szeresére nő; a Cachimayu folyó nyilvánvaló minőségromlást mutat, a fekális kóliformák száma a folyó végén ötszörösére nő; e városi folyók tanulmányozásával a vízfolyások vízgazdálkodásának modelljévé válnak, ezért hasznosak a hasonló folyókon végzett kutatások során történő megismétlésre.
