Genomika az Aws felhőben: Genetikai kód elemzése az Amazon Web Services használatával

Olvasói vélemények

Jelenleg nincsenek olvasói vélemények. Az értékelés 5 olvasói szavazat alapján történt.

Eredeti címe:

Genomics in the Aws Cloud: Analyzing Genetic Code Using Amazon Web Services

Könyv tartalma:

Az adatok genomelemzése és szekvenálása az Amazon Web Services segítségével

Genomika az AWS felhőben: Genetikai kód elemzése az Amazon Web Services használatával lehetővé teszi, hogy az AWS Cloudot mérsékelten ismerő személy teljes genomelemzést és kutatást végezzen. A könyvben található információk segítségével képes lesz arra, hogy egy laboratóriumból származó nyers adatokat tartalmazó FASTQ-fájlt vagy egy szolgáltatótól származó BAM-fájlt fogjon, és elvégezze rajta a genomelemzést. Képes lesz arra is, hogy azonosítsa a potenciálisan patogén génszekvenciákat.

⬤ Egy bevezetést kap a teljes genom szekvenálás (WGS) témakörébe.

⬤ Elérje a WGS értelmét az AWS-en.

⬤ Mesterévé válik a genomelemzésre szolgáló AWS-szolgáltatásoknak.

Az AWS genomikai elemzésekhez való használatának néhány fő előnye, hogy a kutatók a számítási szolgáltatások széles választékát használhatják, amelyek az elemzési pipelinekben különböző adathalmazokat tudnak feldolgozni. A nyers adatfájlokat generáló genomikai szekvenálók a laboratóriumokban helyben találhatók, az AWS pedig olyan megoldásokat kínál, amelyekkel az ügyfelek számára egyszerűvé válik ezeknek a fájloknak az AWS-re történő megbízható és biztonságos átvitele. A genomikai és orvosi (pl. képalkotó) adatok különböző fázisokban történő tárolása hatalmas tárhelyet igényel költséghatékony módon. Az Amazon Simple Storage Service (Amazon S3), az Amazon Glacier és az Amazon Elastics Block Store (Amazon EBS) biztosítja a szükséges megoldásokat a genomikai fájlok biztonságos tárolásához, kezeléséhez és skálázásához. A tárolási szolgáltatások ráadásul az AWS különböző számítási szolgáltatásaival is összekapcsolhatók az említett fájlok feldolgozásához.

Akár most kezdjük, akár már elemezzük a genomikai adatokat az AWS felhő használatával, ez a könyv biztosítja a szükséges információkat ahhoz, hogy az AWS szolgáltatásait és funkcióit a genomikai kutatásaink szempontjából leghasznosabb módon használhassuk.