Értékelés:
Jelenleg nincsenek olvasói vélemények. Az értékelés 9 olvasói szavazat alapján történt.
Quantitative Biology: Theory, Computational Methods, and Models
Bevezetés a biológiai folyamatok kvantitatív modellezésébe, a modellezési megközelítések, módszertan, gyakorlati algoritmusok, szoftvereszközök és aktuális kutatási példák bemutatásával.
A biológiai folyamatok kvantitatív modellezése azt ígéri, hogy a biológiai kutatást a megfigyelés és a felfedezés tudományából a szigorú előrejelzés és a kvantitatív elemzés tudományává bővíti. A kvantitatív biológia gyorsan növekvő területe arra törekszik, hogy a biológiai folyamatok modellezésére felhasználja a biológia újonnan kialakuló technológiai és számítási képességeit. Ez a tankönyv bevezetést nyújt a kvantitatív biológia elméletébe, módszereibe és eszközeibe.
A könyv először a biológiai modellezés alapjait mutatja be, a legszélesebb körben használt formalizmusokra összpontosítva. Ezután bemutatja a biológiai adatok modellvezérelt elemzésének alapvető módszertanát, kitérve az olyan módszerekre, mint a hálózatrekonstrukció, a bizonytalansági számszerűsítés és a kísérlettervezés; a biológiai rendszerek modellezésére szolgáló gyakorlati algoritmusokra és szoftvercsomagokra; valamint a jelenlegi kvantitatív biológiai kutatások és a kapcsolódó speciális módszerek konkrét példáira. A legtöbb fejezet az egyszerűtől az összetettig terjedő problémákat kínál, amelyekkel az olvasó olyan kulcsfontosságú technikák elsajátítását teszi próbára, mint a determinisztikus és sztochasztikus szimulációk és az adatelemzés. Számos fejezet tartalmaz olyan kódrészleteket, amelyek segítségével újra elvégezhetők az elemzések és a szöveghez kapcsolódó ábrák. A példák a három népszerű számítástechnikai nyelven kerülnek bemutatásra: Matlab, R és Python. A szöveget számos online forrás egészíti ki.
A szerkesztők régóta szervezői a 2007-ben alapított q-bio nyári egyetemnek. Az iskola révén a szerkesztők több mint 400 vendéghallgató képzését segítették elő Los Alamosban (Los Alamos, NM, Santa Fe, NM, San Diego, CA, Albuquerque, NM és Fort Collins, CO). Ezt a könyvet az iskola tantervei ihlették, és a legtöbb szerző diákként, előadóként vagy mindkettőként vett részt az iskolában.
Közreműködők.
John H. Abel, Roberto Bertolusso, Daniela Besozzi, Michael L. Blinov, Clive G. Bowsher, Fiona A. Chandra, Paolo Cazzaniga, Bryan C. Daniels, Bernie J. Daigle, Jr, Maciej Dobrzynski, Jonathan P. Doye, Brian Drawert, Sean Fancer, Gareth W. Fearnley, Dirk Fey, Zachary Fox, Ramón Grima, Andreas Hellander, Stefan Hellander, David Hofmann, Damian Hernandez, William S. Hlavacek, Jianjun Huang, Tomasz Jetka, Dongya Jia, Mohit Kumar Jolly, Boris N. Kholodenko, Markek Kimmel, Michal Komorowski, Ganhui Lan, Heeseob Lee, Herbert Levine, Leslie M Loew, Jason G. Lomnitz, Ard A. Louis, Grant Lythe, Carmen Molina-Par s, Ion I. Moraru, Andrew Mugler, Brian Munsky, Joe Natale, Ilya Nemenman, Karol Nienaltowski, Marco S. Nobile, Maria Nowicka, Sarah Olson, Alan S. Perelson, Linda R. Petzold, Sreenivasan Ponnambalam, Arya Pourzanjani, Ruy M. Ribeiro, William Raymond, Herbert M. Sauro, Michael A. Savageau, Abhyudai Singh, James C. Savageau, Abhyudai Singh. Schaff, Boris M. Slepchenko, Thomas R. Sokolowski, Petr Sulc, Andrea Tangherloni, Pieter Rein ten Wolde, Philipp Thomas, Karen Tkach Tuzman, Lev S. Tsimring, Dan Vasilescu, Margaritis Voliotis, Lisa Weber.