Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery
Nyílt hozzáférésű adatbázisok és adathalmazok a gyógyszerkutatáshoz
Időszerű forrás, amely az adatvezérelt gyógyszerkutatás jövőjét és a nyílt forráskódú adatbázisok növekvő számát tárgyalja
Az Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery (Nyílt hozzáférésű adatbázisok és adatállományok a gyógyszerkutatáshoz) a gyógyszertervezés, -fejlesztés és -felfedezés minden aspektusáról szóló 90 szabadon hozzáférhető adatbázis és adatkészlet áttekintésével átfogó útmutató a mai gyógyszeripari kutatók számára elérhető hatalmas mennyiségű "ingyenes adat" számára. Elemzi a nyílt forráskódú adatok alkalmazhatóságát a gyógyszerkutatásban és -fejlesztésben, és értékeli hasznosságukat a kereskedelmi forgalomban kapható eszközökkel összehasonlítva.
A kis molekulák, gyógyszerek és gyógyszerjellegű anyagok, ligandtervezés, fehérjék (kísérleti és számított) 3D struktúrái és humán gyógyszercélpontok szempontjából legfontosabb adatbázisokat részletesen ismertetjük, gyakorlati példákat is bemutatva az adatokhoz való hozzáférésre és az azokkal való munkára. Az első rész a kismolekulákra vonatkozó adatbázisokra összpontosít, majd a makromolekuláris célpontokra és betegségekre vonatkozó adatbázisok következnek. Az utolsó rész bemutatja, hogyan lehet a különböző nyílt forráskódú eszközöket integrálni az akadémiai és ipari gyógyszerkutatási és -fejlesztési folyamatba.
Az Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery (Nyílt hozzáférésű adatbázisok és adatkészletek a gyógyszerkutatáshoz) című könyv, amelyhez a területen régóta dolgozó szakértők járultak hozzá és szerkesztették, a következőkről tartalmaz információkat:
⬤ A számítógéppel támogatott gyógyszertervezéshez szükséges nyílt hozzáférésű adatbázisok és adathalmazok átfogó listája.
⬤ PubChem mint kémiai adatbázis a gyógyszerkutatáshoz, DrugBank Online, és a SwissBioisostere adatbázis által támogatott bioizoszterikus helyettesítés a gyógyszerkutatáshoz.
⬤ A Protein Data Bank (PDB) és a számítógépes gyógyszertervezést támogató makromolekulaszerkezeti adatok, valamint a SWISS-MODEL 3D-s fehérjeszerkezetek és modellek tárháza.
⬤ PDB-REDO a számítással támogatott gyógyszertervezésben (CADD), és a Pharos/TCRD használata a gyógyszerelhető célpontok felfedezéséhez.
A terjedelmében páratlan, és a racionális gyógyszertervezés szempontjából releváns kis és nagy nyílt adatforrásokat alaposan áttekintő Open Access Databases and Datasets for Drug Discovery (Nyílt hozzáférésű adatbázisok és adathalmazok a gyógyszerkutatáshoz) című kötet nélkülözhetetlen referencia az orvos- és gyógyszerkémikusok, valamint a gyógyszerkutatásban és -fejlesztésben részt vevő bármely tudós számára.