Rna-Seq adatelemzés: Gyakorlati megközelítés

Olvasói vélemények

Ez a könyv az RNS-seq technológia részletes bemutatása miatt nagy elismerést vált ki, így ideális a bioinformatika kezdői és oktatói számára. A gyakorlati alkalmazásokat átfogóan tárgyalja, parancssori utasításokat tartalmaz, és valós példákkal könnyíti meg a tanulást. Néhány felhasználó azonban megjegyezte, hogy az ajánlott webhelyekről származó adatok elérhetőségével kapcsolatban problémák merültek fel, és úgy érezte, hogy bizonyos technikai szempontok, különösen az R-rel kapcsolatosak, alulreprezentáltak.

⬤ Rendkívül gyakorlatias és átfogó
⬤ kiváló kezdőknek
⬤ lépésről-lépésre történő utasításokat és valós példákat tartalmaz
⬤ jó a tanításhoz
⬤ önálló, és számos RNS-seq eszközt és módszert tárgyal.

⬤ Néhány adatkészlethez nem lehetett hozzáférni
⬤ nem minden releváns eszközzel foglalkozik
⬤ alulreprezentált az R-ről szóló rész
⬤ inkább a bioinformatikusok, mint a nedves laboratóriumi kutatók felé irányul.

(15 olvasói vélemény alapján)

Eredeti címe:

Rna-Seq Data Analysis: A Practical Approach

Könyv tartalma:

A transzkriptom-elemzés jelenlegi állása Az RNS-szekvenálási (RNS-seq) adatok eddig nem látott információkat nyújtanak a transzkriptomról, de ezen információk bioinformatikai eszközökkel történő hasznosítása jellemzően szűk keresztmetszetet jelent. RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach lehetővé teszi a kutatók számára, hogy gén, exon és transzkript szinteken vizsgálják a differenciált expressziót, és új géneket, transzkripteket és teljes transzkriptomokat fedezzenek fel.

Az elmélet és a gyakorlat kiegyensúlyozott lefedettsége. Minden fejezet elméleti háttérrel kezdődik, amelyet a releváns elemzési eszközök leírása és gyakorlati példák követnek. A bioinformatikusok és a nem programozó nedves laboratóriumi kutatók számára egyaránt hozzáférhető példák a parancssori eszközök, az R és más nyílt forráskódú eszközök, például a grafikus Chipster szoftver használatát szemléltetik.

Az eszközök és módszerek a laboratóriumban való elinduláshoz Ez az önálló útmutató végigvezeti az olvasót a teljes adatelemzési munkafolyamaton, és részletes áttekintést nyújt a főbb RNS-seq adatelemzési módszerekről, valamint elmagyarázza, hogyan lehet őket a gyakorlatban használni. Alkalmas a legkülönbözőbb háttérrel rendelkező kutatók számára, beleértve a biológiát, az orvostudományt, a genetikát és az informatikát. A könyv graduális vagy haladó alapképzésben is használható.