Statisztika és adatelemzés a mikrotérhálózatokhoz az R és a Bioconductor használatával

Olvasói vélemények

A könyv átfogó útmutató a microarray-elemzésről, az R programozásról és a genomikában alkalmazható statisztikai technikákról. Jól megírt, világos magyarázatokkal és magával ragadó tanítási stílussal, amely a különböző háttérrel rendelkező olvasók számára is hozzáférhetővé teszi az összetett témákat. Bár kiváló forrásként szolgál mind a kezdők, mind a tapasztalt szakemberek számára, egyes kritikák szerint bizonyos területeken, különösen a Bioconductor és az RNA-seq elemzés tekintetében, nem elég mélyreható.

A könyv alapos, gazdag tartalmú és jól olvasható. Nagyszerű referenciaként szolgál mind a kezdők, mind a tapasztalt olvasók számára, mivel a biológia, a statisztika és az R programozás alapvető témáit tárgyalja. A szerzőt tanítási képességeiről és humoros nyelvezetéről, valamint arról is elismerik, hogy színes illusztrációkat is tartalmaz, amelyek segítik az összetett fogalmak megértését. Sok olvasó értékeli a szerző részletes magyarázatait és gyakorlatias meglátásait, így a bioinformatika felbecsülhetetlen értékű forrásává válik.

Néhány olvasó időnként nehezen követhetőnek találta a könyvet, különösen az alapvető statisztikákról és az R programozásról szóló hosszú fejezetek miatt. Voltak kritikák a Bioconductorral és a microarray-adatok elemzésével kapcsolatos elégtelen információkkal kapcsolatban, ami egyesek szerint háttérismereteket igényelt. Emellett több vélemény megemlítette az alapvető statisztikai magyarázatok redundanciáját, valamint az RNS-seq-elemzés mélységének érzékelhető hiányát.

(18 olvasói vélemény alapján)

Eredeti címe:

Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor

Könyv tartalma:

A Statistics and Data Analysis for Microarrays Using R and Bioconductor, Second Edition gazdagon illusztrált, színes, világos és szigorú leírást nyújt a biológiai információk bányászatához és értelmezéséhez szükséges hatékony elemzési technikákról és algoritmusokról. Az unalmas részletek, nehézkes formalizmusok és rejtélyes jelölések elhagyásával a szöveg gyakorlatias, példákon alapuló megközelítést alkalmaz, amely megtanítja a hallgatókat az R és a microarray technológia alapjaira, valamint arra, hogyan válasszák ki és alkalmazzák a megfelelő adatelemző eszközt az adott problémákhoz.

Újdonságok a második kiadásban.

A teljesen frissített és elődjéhez képest kétszer akkora terjedelmű, időszerű második kiadás a kereskedelmi szoftvereket a nyílt forráskódú R és Bioconductor környezetekkel helyettesíti. Tizennégy új fejezet foglalkozik olyan témákkal, mint a sejt alapvető mechanizmusai, a DNS-mikroszűrők megbízhatósági és reprodukálhatósági kérdései, alapvető statisztikák és lineáris modellek R-ben, kísérlettervezés, többszörös összehasonlítások, minőségellenőrzés, adatok előfeldolgozása és normalizálása, Gene Ontology elemzés, útvonalelemzés és gépi tanulási technikák. A módszereket játékpéldákkal és valós adatokkal illusztráljuk, és az összes rutin R-kódja elérhető a mellékelt CD-ROM-on.

Ez a bestseller könyv az összes szükséges előfeltételt tartalmazza, és az alapfogalmaktól a fejlett R és Bioconductor elemzési technikákig vezeti a hallgatókat. A szöveg első fele áttekintést nyújt a mikrotérképről és a statisztikai elemekről, amelyek minden adatelemzés építőköveit képezik. A második fele a microarray-adatok elemzése során leggyakrabban használt technikákat mutatja be.