Bioinformatika Python szakácskönyvvel

Olvasói vélemények

A könyv átfogó forrás a számítógépes biológiában dolgozók számára, különös hangsúlyt fektetve a Python gyakorlati alkalmazására a bioinformatika területén. Számos témát érint, többek között az újgenerációs szekvenálást, a populációgenetikát és a fehérjék szerkezetét, kódpéldákat és magyarázatokat kínálva. Mindemellett közepes vagy magas szintű Python-ismeretet és a bioinformatikai terminológia némi ismeretét igényli.

⬤ A számítógépes biológia különböző területeinek átfogó lefedettsége.
⬤ Gyakorlati Python programozási tanácsokat és kódpéldákat tartalmaz.
⬤ Naprakész és jól strukturált tartalom.
⬤ Az anyagok világos és tömör bemutatása.
⬤ Alkalmas a bioinformatika középhaladó és haladó felhasználói számára.

⬤ A Python és a bioinformatikai terminológia előzetes ismerete szükséges.
⬤ Nem alkalmas kezdőknek sem a Python, sem a bioinformatika területén.
⬤ A szoftverek telepítéséről szóló 1. fejezetet egyes, előzetes ismeretekkel rendelkező felhasználók feleslegesnek tarthatják.

(6 olvasói vélemény alapján)

Eredeti címe:

Bioinformatics with Python Cookbook

Könyv tartalma:

Tanulja meg, hogyan használhatja a modern Python bioinformatikai könyvtárakat és alkalmazásokat a számítógépes biológia élvonalbeli kutatásaihoz.

A könyvről

Fedezze fel és tanulja meg a legfontosabb Python könyvtárakat és alkalmazásokat a komplex bioinformatikai elemzések elvégzéséhez Fókuszál a legmodernebb eszközökre az újgenerációs szekvenálással, genomikával, populációgenetikával, filogenomikával és proteomikával végzett kutatásokhoz Használ valós példákat és megtanítja a nagy hatású kutatási módszerek megvalósítását.

Kinek szól ez a könyv

Ha középszintű Python-ismeretekkel rendelkezik, és jól ismeri az Önt érdeklő bioinformatikai témakör főbb kutatási eredményeit és szókincsét, akkor ez a könyv segít továbbfejleszteni a tudását.

Amit tanulni fog

Mélyreható ismereteket szerezhet a Python alapvető bioinformatikai könyvtárairól, és megismerkedhet a Python legfontosabb adattudományi eszközeivel Genomszintű adatok feldolgozása a Biopython segítségével Elemezheti és elvégezheti az újgenerációs szekvenálási adathalmazok minőségellenőrzését olyan könyvtárak segítségével, mint a PyVCF vagy a PySAM Használhatja a DendroPy-t és a Biopythont filogenetikai elemzéshez Populációgenetikai elemzést végezhet nagy adathalmazokon Komplex demográfiák és genomikai jellemzők szimulálása a simuPOP segítségével.

Részletesen

Ha Ön számítógépes biológus vagy Python-programozó, akkor valószínűleg ismeri a „robbanásszerű növekedés, izgalmas idők” kifejezést. A Python vitathatatlanul a big data fő programozási nyelve, és a biológiában a főként a genomikából és a proteomikából származó adatáradat a bioinformatikát az adattudomány egyik legizgalmasabb területévé teszi.

A könyvben található gyakorlatias receptek segítségével Pythonnal végezhet gyakorlati kutatásokat és elemzéseket a számítógépes biológia területén. Kitérünk a modern, következő generációs szekvenálási könyvtárakra, és valós példákon keresztül vizsgáljuk meg, hogyan kezelhetünk valós adatokat. A könyv középpontjában a bioinformatika gyakorlati alkalmazása áll, de kitérünk a modern programozási technikákra és keretrendszerekre is, amelyekkel a bioinformatikai adatok egyre növekvő áradatát kezelhetjük.